Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot P42210 (ASPR_HORVU)

Names and origin

Protein names	Recommended name:     Phytepsin     EC=3.4.23.40 Alternative name(s):     Aspartic proteinase Cleaved into 4 chains:   Recommended name:       Phytepsin 32 kDa subunit   Recommended name:       Phytepsin 29 kDa subunit   Recommended name:       Phytepsin 16 kDa subunit   Recommended name:       Phytepsin 11 kDa subunit
Organism	Hordeum vulgare (Barley)
Taxonomic identifier	4513 [NCBI]
Taxonomic lineage	Eukaryota › Viridiplantae › Streptophyta › Embryophyta › Tracheophyta › Spermatophyta › Magnoliophyta › Liliopsida › Poales › Poaceae › BEP clade › Pooideae › Triticeae › Hordeum

Protein attributes

Sequence length	508 AA.
Sequence status	Complete.
Sequence processing	The displayed sequence is further processed into a mature form.
Protein existence	Evidence at protein level.

General annotation (Comments)

Catalytic activity	Prefers hydrophobic residues Phe, Val, Ile, Leu, and Ala at P1 and P1', but also cleaves -Phe-|-Asp- and -Asp-|-Asp- bonds in 2S albumin from plant seeds.
Subunit structure	Heterodimer of two subunits (29 kDa and 11 kDa) processed from the precursor molecule. A large enzyme (32 kDa and 16 kDa) is an intermediate precursor form.
Subcellular location	Vacuole.
Tissue specificity	Embryo and leaf.
Sequence similarities	Belongs to the peptidase A1 family. Contains 1 saposin B-type domain.

Ontologies

Keywords
Cellular component	Vacuole
Domain	Signal
Molecular function	Aspartyl protease Hydrolase Protease
PTM	Glycoprotein Zymogen
Technical term	3D-structure Direct protein sequencing
Gene Ontology (GO)
None. [Check GOA]

Sequence annotation (Features)

Feature key

Position(s)

Length

Description

Graphical view

Molecule processing

Signal peptide

1 – 22

22

Potential

Propeptide

23 – 66

44

Activation peptide

Chain

67 – 377

311

Phytepsin 32 kDa subunit

Chain

67 – ?

Phytepsin 29 kDa subunit

Chain

378 – 508

131

Phytepsin 16 kDa subunit

Chain

422 – 508

87

Phytepsin 11 kDa subunit

Regions

Domain

314 – 419

106

Saposin B-type

Sites

Active site

102

1

Active site

289

1

Site

377 – 378

2

Cleavage

Site

421 – 422

2

Cleavage

Amino acid modifications

Glycosylation

399

1

N-linked (GlcNAc...) Potential

Disulfide bond

115 ↔ 121

Disulfide bond

280 ↔ 284

Disulfide bond

427 ↔ 464

Secondary structure

1

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

508

Helix Strand Turn

Details...

Beta strand

32 – 37

6

Helix

42 – 49

8

Turn

50

1

Helix

74 – 76

3

Helix

79 – 81

3

Beta strand

84 – 90

7

Turn

91 – 94

4

Beta strand

95 – 102

8

Turn

103 – 104

2

Beta strand

109 – 112

4

Turn

113 – 114

2

Helix

119 – 123

5

Beta strand

127

1

Helix

129 – 131

3

Turn

133 – 134

2

Beta strand

136

1

Beta strand

141 – 146

6

Turn

147 – 148

2

Beta strand

149 – 162

14

Turn

163 – 164

2

Beta strand

165 – 177

13

Beta strand

180

1

Helix

182 – 185

4

Beta strand

190 – 193

4

Helix

197 – 199

3

Helix

201 – 203

3

Helix

207 – 211

5

Turn

212 – 215

4

Beta strand

221 – 225

5

Beta strand

236 – 240

5

Turn

241

1

Turn

245 – 246

2

Beta strand

248 – 260

13

Turn

261 – 262

2

Beta strand

263 – 267

5

Beta strand

270 – 272

3

Turn

273 – 274

2

Beta strand

275 – 276

2

Turn

279 – 282

4

Beta strand

284 – 288

5

Beta strand

295 – 297

3

Helix

299 – 309

11

Turn

310

1

Beta strand

314

1

Helix

317 – 325

9

Turn

326

1

Helix

327 – 335

9

Turn

336 – 337

2

Helix

340 – 346

7

Turn

347 – 348

2

Helix

379 – 397

19

Turn

398 – 399

2

Helix

402 – 412

11

Turn

413 – 414

2

Beta strand

416

1

Beta strand

424 – 425

2

Helix

427 – 430

4

Turn

431 – 432

2

Beta strand

436 – 440

5

Turn

441 – 442

2

Beta strand

443 – 447

5

Helix

449 – 452

4

Beta strand

453 – 455

3

Helix

459 – 461

3

Beta strand

464 – 466

3

Beta strand

468 – 470

3

Turn

475 – 476

2

Beta strand

480 – 483

4

Helix

485 – 488

4

Turn

489 – 490

2

Beta strand

491 – 496

6

Turn

497 – 500

4

Beta strand

501 – 508

8

Sequences

	Sequence		Length	Mass (Da)
	P42210-1 [UniParc]. Last modified November 1, 1995. Version 1. Checksum: 87F2C9F93369B962	FASTA	508	54,226
	10 20 30 40 50 60 MGTRGLALAL LAAVLLLQTV LPAASEAEGL VRIALKKRPI DRNSRVATGL SGGEEQPLLS 70 80 90 100 110 120 GANPLRSEEE GDIVALKNYM NAQYFGEIGV GTPPQKFTVI FDTGSSNLWV PSAKCYFSIA 130 140 150 160 170 180 CYLHSRYKAG ASSTYKKNGK PAAIQYGTGS IAGYFSEDSV TVGDLVVKDQ EFIEATKEPG 190 200 210 220 230 240 ITFLVAKFDG ILGLGFKEIS VGKAVPVWYK MIEQGLVSDP VFSFWLNRHV DEGEGGEIIF 250 260 270 280 290 300 GGMDPKHYVG EHTYVPVTQK GYWQFDMGDV LVGGKSTGFC AGGCAAIADS GTSLLAGPTA 310 320 330 340 350 360 IITEINEKIG AAGVVSQECK TIVSQYGQQI LDLLLAETQP KKICSQVGLC TFDGTRGVSA 370 380 390 400 410 420 GIRSVVDDEP VKSNGLRADP MCSACEMAVV WMQNQLAQNK TQDLILDYVN QLCNRLPSPM 430 440 450 460 470 480 GESAVDCGSL GSMPDIEFTI GGKKFALKPE EYILKVGEGA AAQCISGFTA MDIPPPRGPL 490 500 WILGDVFMGP YHTVFDYGKL RIGFAKAA

References