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UniProtKB/Swiss-Prot Q9BZ11 (ADA33_HUMAN)
Last modified
July 22, 2008.
Version 84.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (8) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: ADAM 33 EC=3.4.24.- Alternative name(s): A disintegrin and metalloproteinase domain 33 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 813 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Expressed in all tissues, except liver, with high expression in placenta, lung, spleen and veins. |
| Domain | The conserved cysteine present in the cysteine-switch motif binds the catalytic zinc ion, thus inhibiting the enzyme. The dissociation of the cysteine from the zinc ion upon the activation-peptide release activates the enzyme. |
| Post-translational modification | The precursor is cleaved by a furin endopeptidase By similarity. |
| Involvement in disease | Defects in ADAM33 may be a cause of susceptibility to asthma. |
| Sequence similarities | Contains 1 disintegrin domain. Contains 1 EGF-like domain. Contains 1 peptidase M12B domain. |
Ontologies
Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Domain | EGF-like domain Signal Transmembrane |
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Hydrolase Metalloprotease Protease |
| PTM | Cleavage on pair of basic residues Glycoprotein Phosphoprotein Zymogen |
| Technical term | 3D-structure |
Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | proteolysis Ref.1 Non-traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Cellular component | integral to membrane Ref.1 Non-traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Molecular function | metalloendopeptidase activity Ref.1 Non-traceable author statement. Source: UniProtKB zinc ion binding Ref.1Non-traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | |||||
| Isoform 1 (identifier: Q9BZ11-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | |||||
| Isoform 2 (identifier: Q9BZ11-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 636-661: Missing. | |||||
| Notes: Described in Ref.1. | |||||
| Isoform 3 (identifier: Q9BZ11-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-478: Missing. 636-661: Missing. | |||||
| Notes: No experimental confirmation available. By similarity with mouse isoform. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 29 | 29 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Propeptide | 30 – 203 | 174 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 204 – 813 | 610 | ADAM 33 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 30 – 701 | 672 | Extracellular Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 702 – 722 | 21 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 723 – 813 | 91 | Cytoplasmic Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 210 – 409 | 200 | Peptidase M12B | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 417 – 503 | 87 | Disintegrin | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 649 – 681 | 33 | EGF-like | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 131 – 138 | 8 | Cysteine switch By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 503 – 648 | 146 | Cys-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 346 | 1 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 133 | 1 | Zinc (in inhibited form) By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 345 | 1 | Zinc (catalytic) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 349 | 1 | Zinc (catalytic) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 355 | 1 | Zinc (catalytic) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 269 | 1 | Phosphoserine | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 109 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 145 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 231 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 276 | 1 | N-linked (GlcNAc...) | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 448 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 320 ↔ 404 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 360 ↔ 388 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 361 ↔ 371 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 475 ↔ 495 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 653 ↔ 663 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 657 ↔ 669 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 671 ↔ 680 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 478 | 478 | Missing in isoform 3. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 636 – 661 | 26 | Missing in isoform 2 and isoform 3. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 109 | 1 | N → S: dbSNP rs41467948. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 178 | 1 | T → A: dbSNP rs3918392. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 272 | 1 | T → M | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 316 | 1 | V → I | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 336 | 1 | P → S: dbSNP rs41483049. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 365 | 1 | A → S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 441 | 1 | D → E | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 515 | 1 | W → R | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 612 | 1 | L → H | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 710 | 1 | V → I | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 739 | 1 | C → G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 742 | 1 | D → Y | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 764 | 1 | M → T: dbSNP rs2280091. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 774 | 1 | P → S: dbSNP rs2280090. | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 802 | 1 | Missing in AAM80482 and AAM80483. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 210 – 218 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 220 – 225 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 226 – 228 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 230 – 249 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 250 – 252 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 253 – 262 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 264 – 266 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 275 – 292 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 296 – 304 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 322 – 324 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 326 – 330 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 333 – 335 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 336 – 350 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 366 – 368 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 398 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 399 – 402 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 403 – 405 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Identification and characterization of novel mouse and human ADAM33s with potential metalloprotease activity." Yoshinaka T., Nishii K., Yamada K., Sawada H., Nishiwaki E., Smith K., Yoshino K., Ishiguro H., Higashiyama S. Gene 282:227-236(2002) [PubMed: 11814695] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2), TISSUE SPECIFICITY. Tissue: Testis. |
| [2] | "Association of the ADAM33 gene with asthma and bronchial hyperresponsiveness." Van Eerdewegh P., Little R.D., Dupuis J., Del Mastro R.G., Falls K., Simon J., Torrey D., Pandit S., McKenny J., Braunschweiger K., Walsh A., Liu Z., Hayward B., Folz C., Manning S.P., Bawa A., Saracino L., Thackston M. Keith T.P.Nature 418:426-430(2002) [PubMed: 12110844] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA / MRNA] (ISOFORM 1), INVOLVEMENT IN ASTHMA. Tissue: Uterus. |
| [3] | "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment." Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., Baker K., Baldwin D.T., Brush J., Chen J., Chow B., Chui C., Crowley C., Currell B., Deuel B., Dowd P., Eaton D., Foster J.S., Grimaldi C., Gu Q., Hass P.E. Gray A.M.Genome Res. 13:2265-2270(2003) [PubMed: 12975309] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). |
| [4] | "NIEHS-SNPs, environmental genome project, NIEHS ES15478, Department of Genome Sciences, Seattle, WA (URL: http://egp.gs.washington.edu)." Livingston R.J., Rieder M.J., Shaffer T., Bertucci C., Baier C.N., Rajkumar N., Willa H.T., Stanaway I.B., Nguyen C.P., Gildersleeve H., Johnson E.J., Swanson J.E., McFarland I., Park C., Nickerson D.A. Submitted (SEP-2006) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANTS SER-109; ALA-178; MET-272; ILE-316; SER-336; SER-365; GLU-441; ARG-515; HIS-612; ILE-710; GLY-739; TYR-742; THR-764 AND SER-774. |
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Clusters with